COVID-19 symptoms at hospital admission vary with age and sex: results from the ISARIC prospective multinational observational study

Background: The ISARIC prospective multinational observational study is the largest cohort of hospitalized patients with COVID-19. We present relationships of age, sex, and nationality to presenting symptoms. Methods: International, prospective observational study of 60 109 hospitalized symptomatic patients with laboratory-confirmed COVID-19 recruited from 43 countries between 30 January and 3 August 2020. Logistic regression was performed to evaluate relationships of age and sex to published COVID-19 case definitions and the most commonly reported symptoms. Results: ‘Typical’ symptoms of fever (69%), cough (68%) and shortness of breath (66%) were the most commonly reported. 92% of patients experienced at least one of these. Prevalence of typical symptoms was greatest in 30- to 60-year-olds (respectively 80, 79, 69%; at least one 95%). They were reported less frequently in children (≤ 18 years: 69, 48, 23; 85%), older adults (≥ 70 years: 61, 62, 65; 90%), and women (66, 66, 64; 90%; vs. men 71, 70, 67; 93%, each P < 0.001). The most common atypical presentations under 60 years of age were nausea and vomiting and abdominal pain, and over 60 years was confusion. Regression models showed significant differences in symptoms with sex, age and country. Interpretation: This international collaboration has allowed us to report reliable symptom data from the largest cohort of patients admitted to hospital with COVID-19. Adults over 60 and children admitted to hospital with COVID-19 are less likely to present with typical symptoms. Nausea and vomiting are common atypical presentations under 30 years. Confusion is a frequent atypical presentation of COVID-19 in adults over 60 years. Women are less likely to experience typical symptoms than men

Génétique des fibroses pulmonaires familiales de l’adulte

About 10% of patients with idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) have at least one relative with interstitial lung disease (ILD). Mutations had been reported on the genes encoding for the proteins involved in the surfactant metabolism and in the telomerase complex In adults, TERT mutations were the most frequent (˜15%), mutations of TERC, DKC1 and TINF2 more rarely found. Approximately 80% of the familial forms of pulmonary fibroses in adults were unidentified. The objectives of this work were: 1) to identify a new gene involved in unexplained adult familial pulmonary fibrosis, 2) to better characterize the phenotype of patients with mutations of TERT, TERC or the new gene detected. We selected 35 families with familial pulmonary fibrosis for which the TERT, TERC, ABCA3, SFTPB and SFTPC mutation search was negative, to perform exome sequencing. Four of the 35 families analyzed showed a very rare variant on RTEL1 in the heterozygous state. The presence of the variants was confirmed by Sanger sequencing. These variants were absent from the control databases. In silico predictions were in favor of the pathogenicity of these variants.In families, the variants co-segregated with the disease. In 3D modeling, analysis of the variants suggested a functional impact at the ATP or DNA binding site. The telomere length of carriers of the mutations was shortened compared to controls in the same age group. In 2014, 237 patients with pulmonary fibrosis (153 with familial pulmonary fibrosis, 84 with telomere syndrome) were sequenced for TERC and TERT. The variants were classified as pathogenic in 40 patients (16.8%). An early age of diangosis, macrocytosis, or thrombocytopenia were significantly associated with the presence of a mutation.The probability of a mutation was greatest for patients aged 40-60 years. The median survival without transplantation was lower for patients with TERT or TERC mutations.We performed a sequencing of the exoma in 40 other families and showed 5 new variants of RTEL1 probably pathogenic in silico. We also demonstrated 3 other mutations of RTEL1 in a cohort of ILD associated with rheumatoid arthritis. We collected data from 35 patients with ILD carriers of RTEL1 heterozygous mutations. Twenty patients had IPF (57%) and 10 a secondary ILD (25.7%). Unlike mutations within TERT or TERC, RTEL1 mutations were associated with fewer hematological abnormalities.Furthermore, the pulmonary expression of the RTEL1 protein evaluated by immunohistochemistry and mRNA by PCR was equivalent in patients carriers of RTEL1 or TERT mutations or IPF without mutation. We identified and confirmed the implication of a new gene, RTEL1, in about 10% of familial pulmonary fibroses. The presence of macrocytosis, thrombocytopenia or a young age is predictive of the presence of a mutation within TERT or TERC. The penetrance of hematological diseases appears to be lower for RTEL1 mutation carriers than for TERT or TERC mutation carriers in our cohort of ILD patient. Mutations of TERT or RTEL1 are frequently associated with secondary ILDEnviron 10 % des patients atteints de fibrose pulmonaire idiopathique (FPI) ont au moins un apparenté atteint de pneumopathie interstitielle diffuse (PID). Des mutations avaient été mises en évidence sur les gènes codant pour les protéines impliquées dans le métabolisme du surfactant et les protéines du complexe télomérase. Chez l’adulte, les mutations de TERT étaient les plus fréquentes (˜15 %), les mutations de TERC, DKC1 et TINF2 plus rarement retrouvées. Environ 80 % des formes familiales de fibroses pulmonaires chez l’adulte étaient sans cause identifiée. Les objectifs de cette thèse étaient : 1) d’identifier un nouveau gène en cause dans les fibroses pulmonaires familiales de l’adulte inexpliquées, 2) de mieux caractériser le phénotype des patients présentant des mutations de TERT, de TERC ou du nouveau gène mis en évidence.Nous avons sélectionné 35 familles présentant une fibrose pulmonaire familiale pour lesquelles la recherche de mutation TERT, TERC, ABCA3, SFTPB et SFTPC était négative, pour réaliser un séquençage de l’exome. Quatre familles sur les 35 analysées présentaient un variant très rare sur RTEL1 à l’état hétérozygote. La présence des variants a été confirmée par séquençage selon la méthode de Sanger. Ces variants étaient absents des bases de données de contrôles. Les prédictions in silico étaient en faveur du caractère pathogène de ces variants. Les variants co-ségrégeaient avec la maladie dans les familles.L’analyse des variants à partir de la modélisation en 3D de la protéine suggérait un impact fonctionnel des variants sur le site de fixation à l’ATP ou à l’ADN. La taille des télomères des patients étaient raccourcies en comparaison des témoins de la même catégorie d’âge. En 2014, 237 patients avec une fibrose pulmonaire (153 avec une fibrose pulmonaire familiale, 84 avec un syndrome télomère) avaient bénéficié d’un séquençage de TERC et de TERT. Les variants ont été classés comme pathogènes chez 40 patients (16,8 %). Un âge de survenue précoce de fibrose, une macrocytose, ou une thrombopénie étaient significativement associée avec la présence d’une mutation. La probabilité d’une mutation était la plus importante pour les patients de 40-60 ans. La médiane de survie sans transplantation était plus faible pour les patients porteurs de mutations de TERT ou de TERC. Nous avons réalisé un séquençage de l’exome chez 40 autres familles et mis en évidence 5 nouveaux variants de RTEL1 probablement pathogènes in silico. Nous avons par ailleurs mis en évidence 3 autres mutations de RTEL1 dans une cohorte de PID associées à une polyarthrite rhumatoïde. Nous avons colligé les données de 35 patients atteints de PID et porteurs de mutations hétérozygotes de RTEL1. Vingt patients présentaient une FPI (57 %) et 10 une PID secondaire (25,7%). A la différence des mutations de TERT ou TERC, les mutations de RTEL1 étaient associées à moins d’anomalies hématologiques. Par ailleurs, l’expression pulmonaire de la protéine RTEL1 évaluée par immuno-histochimie et de l’ARNm par PCR était équivalente chez les patients porteurs de mutations RTEL1, de TERT ou atteints de FPI sans mutation. Nous avons identifié et confirmé l’implication d’un nouveau gène, RTEL1, dans environ 10 % des fibroses pulmonaires familiales. La présence d’une macrocytose, d’une thrombopénie ou d’un âge jeune en présence d’une forme familiale de fibrose est prédictive de la présence d’une mutation de TERT ou de TERC. La pénétrance des maladies hématologiques semble plus faible pour les mutations de RTEL1 que pour celles de TERT ou TERC dans notre cohorte recrutée sur l’atteinte pulmonaire. Les mutations de TERT ou de RTEL1 sont fréquemment associées à des PID secondaire

Genetics of adult familial pulmonary fibrosis

Environ 10 % des patients atteints de fibrose pulmonaire idiopathique (FPI) ont au moins un apparenté atteint de pneumopathie interstitielle diffuse (PID). Des mutations avaient été mises en évidence sur les gènes codant pour les protéines impliquées dans le métabolisme du surfactant et les protéines du complexe télomérase. Chez l’adulte, les mutations de TERT étaient les plus fréquentes (˜15 %), les mutations de TERC, DKC1 et TINF2 plus rarement retrouvées. Environ 80 % des formes familiales de fibroses pulmonaires chez l’adulte étaient sans cause identifiée. Les objectifs de cette thèse étaient : 1) d’identifier un nouveau gène en cause dans les fibroses pulmonaires familiales de l’adulte inexpliquées, 2) de mieux caractériser le phénotype des patients présentant des mutations de TERT, de TERC ou du nouveau gène mis en évidence.Nous avons sélectionné 35 familles présentant une fibrose pulmonaire familiale pour lesquelles la recherche de mutation TERT, TERC, ABCA3, SFTPB et SFTPC était négative, pour réaliser un séquençage de l’exome. Quatre familles sur les 35 analysées présentaient un variant très rare sur RTEL1 à l’état hétérozygote. La présence des variants a été confirmée par séquençage selon la méthode de Sanger. Ces variants étaient absents des bases de données de contrôles. Les prédictions in silico étaient en faveur du caractère pathogène de ces variants. Les variants co-ségrégeaient avec la maladie dans les familles.L’analyse des variants à partir de la modélisation en 3D de la protéine suggérait un impact fonctionnel des variants sur le site de fixation à l’ATP ou à l’ADN. La taille des télomères des patients étaient raccourcies en comparaison des témoins de la même catégorie d’âge. En 2014, 237 patients avec une fibrose pulmonaire (153 avec une fibrose pulmonaire familiale, 84 avec un syndrome télomère) avaient bénéficié d’un séquençage de TERC et de TERT. Les variants ont été classés comme pathogènes chez 40 patients (16,8 %). Un âge de survenue précoce de fibrose, une macrocytose, ou une thrombopénie étaient significativement associée avec la présence d’une mutation. La probabilité d’une mutation était la plus importante pour les patients de 40-60 ans. La médiane de survie sans transplantation était plus faible pour les patients porteurs de mutations de TERT ou de TERC. Nous avons réalisé un séquençage de l’exome chez 40 autres familles et mis en évidence 5 nouveaux variants de RTEL1 probablement pathogènes in silico. Nous avons par ailleurs mis en évidence 3 autres mutations de RTEL1 dans une cohorte de PID associées à une polyarthrite rhumatoïde. Nous avons colligé les données de 35 patients atteints de PID et porteurs de mutations hétérozygotes de RTEL1. Vingt patients présentaient une FPI (57 %) et 10 une PID secondaire (25,7%). A la différence des mutations de TERT ou TERC, les mutations de RTEL1 étaient associées à moins d’anomalies hématologiques. Par ailleurs, l’expression pulmonaire de la protéine RTEL1 évaluée par immuno-histochimie et de l’ARNm par PCR était équivalente chez les patients porteurs de mutations RTEL1, de TERT ou atteints de FPI sans mutation. Nous avons identifié et confirmé l’implication d’un nouveau gène, RTEL1, dans environ 10 % des fibroses pulmonaires familiales. La présence d’une macrocytose, d’une thrombopénie ou d’un âge jeune en présence d’une forme familiale de fibrose est prédictive de la présence d’une mutation de TERT ou de TERC. La pénétrance des maladies hématologiques semble plus faible pour les mutations de RTEL1 que pour celles de TERT ou TERC dans notre cohorte recrutée sur l’atteinte pulmonaire. Les mutations de TERT ou de RTEL1 sont fréquemment associées à des PID secondairesAbout 10% of patients with idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) have at least one relative with interstitial lung disease (ILD). Mutations had been reported on the genes encoding for the proteins involved in the surfactant metabolism and in the telomerase complex In adults, TERT mutations were the most frequent (˜15%), mutations of TERC, DKC1 and TINF2 more rarely found. Approximately 80% of the familial forms of pulmonary fibroses in adults were unidentified. The objectives of this work were: 1) to identify a new gene involved in unexplained adult familial pulmonary fibrosis, 2) to better characterize the phenotype of patients with mutations of TERT, TERC or the new gene detected. We selected 35 families with familial pulmonary fibrosis for which the TERT, TERC, ABCA3, SFTPB and SFTPC mutation search was negative, to perform exome sequencing. Four of the 35 families analyzed showed a very rare variant on RTEL1 in the heterozygous state. The presence of the variants was confirmed by Sanger sequencing. These variants were absent from the control databases. In silico predictions were in favor of the pathogenicity of these variants.In families, the variants co-segregated with the disease. In 3D modeling, analysis of the variants suggested a functional impact at the ATP or DNA binding site. The telomere length of carriers of the mutations was shortened compared to controls in the same age group. In 2014, 237 patients with pulmonary fibrosis (153 with familial pulmonary fibrosis, 84 with telomere syndrome) were sequenced for TERC and TERT. The variants were classified as pathogenic in 40 patients (16.8%). An early age of diangosis, macrocytosis, or thrombocytopenia were significantly associated with the presence of a mutation.The probability of a mutation was greatest for patients aged 40-60 years. The median survival without transplantation was lower for patients with TERT or TERC mutations.We performed a sequencing of the exoma in 40 other families and showed 5 new variants of RTEL1 probably pathogenic in silico. We also demonstrated 3 other mutations of RTEL1 in a cohort of ILD associated with rheumatoid arthritis. We collected data from 35 patients with ILD carriers of RTEL1 heterozygous mutations. Twenty patients had IPF (57%) and 10 a secondary ILD (25.7%). Unlike mutations within TERT or TERC, RTEL1 mutations were associated with fewer hematological abnormalities.Furthermore, the pulmonary expression of the RTEL1 protein evaluated by immunohistochemistry and mRNA by PCR was equivalent in patients carriers of RTEL1 or TERT mutations or IPF without mutation. We identified and confirmed the implication of a new gene, RTEL1, in about 10% of familial pulmonary fibroses. The presence of macrocytosis, thrombocytopenia or a young age is predictive of the presence of a mutation within TERT or TERC. The penetrance of hematological diseases appears to be lower for RTEL1 mutation carriers than for TERT or TERC mutation carriers in our cohort of ILD patient. Mutations of TERT or RTEL1 are frequently associated with secondary IL

Atteintes pulmonaires au cours de la cirrhose biliaire primitive

La cirrhose biliaire primitive (CBP) est une hépatopathie auto-immune. Des atteintes de l'appareil respiratoire ont été décrites au cours de la maladie. Elles peuvent être en rapport avec les complications de la cirrhose (hypertension artérielle pulmonaire, syndrome hépatorénal), avec une maladie systémique associée à la CBP (Syndrome de Gougerot-Sjögren, sclérodermie, sarcoïdose) ou être en rapport avec une atteinte spécifique de la CBP. L'ensemble des composants de l'appareil respiratoire peut être touché au cours d'une CBP : le diaphragme, les bronches et les bronchioles, les vaisseaux pulmonaires, et le parenchyme. Les études systématiques ont démontré la grande fréquence de la diminution de la DLCO et d'une alvéolite lymphocytaire à prédominance de lymphocyte CD4+ (50 % des patients). De rares observations de fibrose pulmonaire sont décrites dans la littérature. Nous rapportons 3 observations de patients atteints de CBP et présentant une pneumopathie interstitielle fibrosante. Dans 2 cas, il existe un Syndrome de Gougerot-Sjögren associé. L'atteinte pulmonaire est révélatrice de l'hépatopathie dans 2 cas et responsable du décès dans un cas. Une patiente s'améliore sous corticoïdes oraux. Il n'y a pas eu de biopsie pulmonaire. Ces observations démontrent la nécessité pour les pneumologues de rechercher systématiquement des anomalies du bilan hépatique au cours du bilan et du suivi d'une pneumopathie interstitielle, et soulignent le caractère potentiellement grave de l'atteinte pulmonaire au cours de la CBP.PARIS7-Xavier Bichat (751182101) / SudocPARIS-BIUM (751062103) / SudocSudocFranceF

Dams select individual morphology but do not modify upstream migration speed of tropical amphidromous gobies

International audienceFish locomotor performance depends on inter-individual morphological differences and influences the response of populations to anthropogenic impacts. Amphidromous gobies, Sicyopterus lagocephalus and Cotylopus acutipinnis can climb up obstacles several metres high, after their arrival in rivers from the ocean. A previous study demonstrated that juveniles of S. lagocephalus performed better than C. acutipinnis when challenged with an artificial climbing ramp, and that individual morphology explained climbing performance for both species. This present study was focused on the effects of two 10-m high dams on the individual morphological selection of these species. We hypothesized that, compared with C. acutipinnis, (a) S. lagocephalus juveniles will reach the dams faster after they arrive in freshwater and (b) their morphology will play a lesser role in their capacity to climb up the dams. Anatomical traits were measured for 186 and 201 S. lagocephalus and 179 and 221 C. acutipinnis captured downstream and upstream of the dams, respectively. The time they spent in freshwater was estimated by examining the microstructures of their otoliths. As expected, S. lagocephalus individuals reached the dams 10–20 days faster than C. acutipinnis, and their morphology upstream and downstream of the dams did not differ, in contrast to C. acutipinnis. Upstream of the dam, C. acutipinnis had a larger pelvic sucker than downstream, confirming experimental observations. It suggests that juveniles of the cosmopolitan S. lagocephalus have more efficient upstream migration capacities than the endemic C. acutipinnis. Moreover, differences in individual morphologies above and below barriers appear efficient for quantifying their impact on upstream migration of amphidromous species

Respiratory Distress, Congenital Hypothyroidism and Hypotonia in a Newborn

No abstract availabl

Climbing Waterfalls: How Metabolism and Behavior Impact Locomotor Performance of Tropical Climbing Gobies on Reunion Island

International audienceThe life cycle of gobies of the Sicydiinae subfamily depends on climbing waterfalls. Two sympatric sicydiines species from Reunion Island, Sicyopterus lagocephalus (SIL) and Cotylopus acutipinnis (COA), employ different climbing modes. SIL uses a steady “inching” mode interrupted by short rest periods, whereas COA exhibits short “power-burst” undulatory movements punctuated by longer rest periods. Consequently, we explored the relationship between climbing performance and metabolic activity in these two species. We demonstrated that the two climbing modes are supported by different ecophysiological profiles that promote the interspecific variability of locomotor performance. More specifically, SIL performed better than COA during a climbing experiment because of its inching climbing mode, supported by a generally greater metabolic capacity and a higher potential for oxidative metabolism. Interestingly, we did not detect any difference in metabolic fuel storage and lactate production during climbing in either species, suggesting that these species can maintain fuel reserves and limit lactate accumulation through extensive rest times. Overall, this study provides new insights into the ecophysiology of these two emblematic species and suggests that the better climbing capacity of SIL is supported by its muscular metabolic capacity

Climbing Waterfalls: How Metabolism and Behavior Impact Locomotor Performance of Tropical Climbing Gobies on Reunion Island

The life cycle of gobies of the Sicydiinae subfamily depends on climbing waterfalls. Two sympatric sicydiines species from Reunion Island, Sicyopterus lagocephalus (SIL) and Cotylopus acutipinnis (COA), employ different climbing modes. SIL uses a steady “inching” mode interrupted by short rest periods, whereas COA exhibits short “power-burst” undulatory movements punctuated by longer rest periods. Consequently, we explored the relationship between climbing performance and metabolic activity in these two species. We demonstrated that the two climbing modes are supported by different ecophysiological profiles that promote the interspecific variability of locomotor performance. More specifically, SIL performed better than COA during a climbing experiment because of its inching climbing mode, supported by a generally greater metabolic capacity and a higher potential for oxidative metabolism. Interestingly, we did not detect any difference in metabolic fuel storage and lactate production during climbing in either species, suggesting that these species can maintain fuel reserves and limit lactate accumulation through extensive rest times. Overall, this study provides new insights into the ecophysiology of these two emblematic species and suggests that the better climbing capacity of SIL is supported by its muscular metabolic capacity